Ho fatto dei test in locale e non sono riuscito a riprodurre il problema, rispondendo a punti:
1) Una determinata identità con Admin Server Query sarà come tale in tutti i virtualserver creati
2) Seguendo la stessa procedura, cambiando soltanto il "use <numero>", si può mettere Admin Server Query qualsiasi utente su qualsiasi virtualserver

Il comportamento che descrivi sembra essere dovuto al fatto che o si sta parlando involontariamente di due virtualserver differenti e non sotto lo stesso server o di una malconfigurazione dei permessi Admin Server Query (perchè manomessi). Sarebbe interessante avere l'errore che ti viene restituito.