A me è successo che trasferendo il server da un VPS con Centos 5.7 ad un altro VPS con Centos 5.7, quindi sistema identico, il server non si avviava perchè voleva le cartelle dei server virtuali...Originariamente Scritto da Fefe
Quindi credo che il tuo problema sia lo stesso...
Ovviamente quando passi a Windows devi mettere i file di avvio per Windows