Dentro la cartella del server /doc dovresti trovare un file chiamato "ts3_serverquery_manual.pdf", li trovi tutti i comandi utili, tra cui lo start e stop dei server virtuali (pagina 10 e 11). I server sono indipendenti tra loro, li puoi avviare quando e come vuoi. Il file .ini non torna utile in nessuno modo per la gestione dei server virtuali e per il momento non ho "in cantiere" nessuna guida in merito.